Als Student war er Mitglied der Muslimbruderschaft, hat sich aber später radikal vom Islam abgewandt. Abdel-Samad hat viele Bücher über den Islam geschrieben, unter anderem Der islamische Faschismus.

Als er diesen bei einem Vortrag in Kairo 2013 unmittelbar mit der Geschichte des Islams in Zusammenhang brachte, wurde im ägyptischen Fernsehen wegen angeblicher Beleidigung des Propheten zu seiner Ermordung aufgerufen.

Seitdem lebt Hamed Abdel-Samad unter Polizeischutz, der im Laufe der Jahre wegen seiner Bücher noch verstärkt werden musste, die häufig Bestseller sind wie eines seiner Hauptwerke Islam, eine kritische Geschichte und sein aktuelles Buch Der Preis der Freiheit. Eine Warnung an den Westen.